Храм в честь Рождества Христова был открыт в Немчиновке в 1914 году. Основатель поселка М. А. Немчинов передал под эти нужды свой жилой деревянный дом. Изначально церковь напоминала храм Сергия Радонежского в Эммануиловке и имела колокольню с шестью колоколами.
В советское время храм был полностью разрушен, на его месте построен клуб.
3 февраля 2005 года началось строительство нового храма. Центральный престол храма был назван в честь Рождества Христова, боковой придел — в честь иконы Божией Матери «Утоли моя печали», придел в цокольном этаже с крестильным храмом — в честь священномученика диакона Елисея Штольдера, служившего в церкви и расстрелянного на Бутовском полигоне.

Первое богослужение в храме состоялось на праздник Рождества Христова в 2007 году.